Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms