Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MXD3Q9BW11 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MXD3Q9BW11 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms