Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4K2AQ9BTU6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4K2AQ9BTU6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms