Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms