Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RTKNQ9BST9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RTKNQ9BST9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms