Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERPUD2Q9BSE4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERPUD2Q9BSE4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERPUD2Q9BSE4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERPUD2Q9BSE4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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