Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM2D3Q9BRN9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms