Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms