Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN18Q99952 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN18Q99952 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms