Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP8Q99708 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms