Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGRRF1Q99675 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1Q99675 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms