Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms