Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN18Q96SJ8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN18Q96SJ8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms