Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCEEQ96PE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms