Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIM3Q96PE6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIM3Q96PE6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms