Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRELID3AQ96N28 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3AQ96N28 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms