Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00479Q96M42 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00479Q96M42 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms