Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A4AQ96JQ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A4AQ96JQ5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms