Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED3Q96IU2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED3Q96IU2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED3Q96IU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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