Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM46AQ96IP4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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FAM46AQ96IP4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM46AQ96IP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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