Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBM17Q96I25 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms