Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC10A4Q96EP9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms