Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLUAP1Q96AJ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLUAP1Q96AJ1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms