Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RERGQ96A58 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RERGQ96A58 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms