Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYAP1Q96A49 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYAP1Q96A49 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms