Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms