Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms