Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMO7Q8WWI1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMO7Q8WWI1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms