Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC4Q8WW27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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