Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO3Q8TAP4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms