Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms