Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP37Q8NFH4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP37Q8NFH4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms