Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF548Q8NEK5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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