Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
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TTC21AQ8NDW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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TTC21AQ8NDW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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TTC21AQ8NDW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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TTC21AQ8NDW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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TTC21AQ8NDW8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
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TTC21AQ8NDW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC21AQ8NDW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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TTC21AQ8NDW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC21AQ8NDW8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
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