Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms