Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL3Q8N8U3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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