Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1B4

VPS52, Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS52Q8N1B4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS52Q8N1B4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS52Q8N1B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms