Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPAP2Q8IXW5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms