Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT2Q8IXI1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms