Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLF2Q8IX21 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLF2Q8IX21 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms