Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB11FIP4Q86YS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms