Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB4Q86W47 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB4Q86W47 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms