Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT28Q7Z3Y7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT28Q7Z3Y7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms