Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP2Q7RTS6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms