Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTF1AQ7RTS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms