Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2BQ7L1I2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms