Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2AFVQ71UI9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms