Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC25A48Q6ZT89 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms