Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms