Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SARM1Q6SZW1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SARM1Q6SZW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms